文章摘要:细菌分子分型已成为监测细菌感染性疾病的暴发流行与明确病原菌传播途径的重要工具。随着全基因组测序技术的日益兴起，公共数据库中已产生大量的细菌基因组数据，迫切需要研究人员充分认识和理解该技术，并掌握多种生物信息学工具挖掘并解读测序数据。本文系统概述了全基因组测序技术与生物信息学工具在病原菌分型与溯源中的应用，并对全基因组测序技术在临床诊疗实践中存在的挑战以及未来应用前景进行了探讨。

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