文章摘要:目的 基于宏基因组二代测序(mNGS)诊断的鹦鹉热衣原体肺炎的流行病学特征分析。方法 由微远基因科技有限公司和迪飞医学科技有限公司提供宏基因组二代测序数据(分别为数据集Ⅰ和数据集Ⅱ),包括:鹦鹉热衣原体检测阳性患者的性别、年龄、所在城市、检测样本种类、检测时间、检测鹦鹉热衣原体的DNA序列数以及相应时间段内进行mNGS检测的肺炎患者病例数。数据纳入统计学软件进行分析。结果 2019年4月至2021年1月间共检标本11 514例,阳性患者132例,检出率为1.1%(132/11 514)。春季(3月、4月、5月)和夏季(6月、7月、8月)共44例,占总病例数的33.3%。秋季(9月、10月、11月)和冬季(12月、1月、2月) 88例,占总病例数的66.7%。北方患者群感染鹦鹉热衣原体阳性检出率为0.5%(9/1 756),南方患者群阳性检出率为1.3%(123/9 758)。132例阳性病例主要由呼吸科、重症医学科、急诊科和感染科收治,占总病例数的94.7%(125/132)。来源于阳性病例的样本数量179个,其中肺泡灌洗液、血液和痰液共172个,占96.1%(172/179)。肺泡灌洗液标本阳性率高,数据集Ⅰ和数据集Ⅱ分别为100%和96.8%;而血液标本的阳性率稍低,分别为81.3%和67.6%。结论 鹦鹉热衣原体肺炎发病率较高的季节在秋冬季,我国秦岭淮河以南地区的检出率高于秦岭淮河以北地区。用于检测的标本,首选为肺泡灌洗液。

文章关键词:宏基因组二代测序,鹦鹉热衣原体,肺炎,流行病学特征,

项目基金:国家自然科学基金(81774081),

论文作者:陆晓旻¹ 朱际平¹ 陈扬² 戴海宁³ 

作者单位:2. 迪飞医学科技有限公司 

论文分类号: R563.1;R181.3

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