《药物流行病学杂志》
文章摘要:为分析福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征,采集咽拭子标本采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)筛查麻疹病毒核酸。用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒核酸筛查阳性咽拭子及Vero/Slam细胞培养阳性产物,对麻疹病毒核蛋白(Nucleoprotein,N)羧基(COOH)端634个核苷酸(Nucleotides,nt)片段进行测序分析,构建系统进化树。最终分离获得1株麻疹病毒株,26条麻疹病毒N蛋白羧基末端450个nt序列。亲缘性分析发现,所有福建麻疹毒株与WHO D8基因型参考株(MVi/Manchester.GBR/30.94)在亲缘关系树上同属一个大分支,两者核苷酸序列和氨基酸(Amino acid,aa)序列同源性分别为96.4%~99.1%和96.7%~98.0%。其中2014年的福建毒株MVs/Fujian.CHN/28.14和MVs/Fujian.CHN/30.14与越南胡志明市2014年分离株MVs/HoChiMinh.VNM/11.14及美国纽约2013年分离株MVs/New_York.USA/19.13的nt同源性为100%;2019年的毒株MVs/Fujian.CHN/25.19与泰国龙仔厝府2018年分离株MVs/Samut_Sakhon.THA/8.18的nt同源性为100%;而剩余的23个监测毒株则与日本神户2019年分离株MVs/KobeC.JPN/28.19的核苷酸同源性和氨基酸同源性最高,分别为99.6%~100.0%和99.3%~100.0%。在病毒N蛋白羧基端150个氨基酸位点上,福建株与WHO D8参考株存在3~5个氨基酸位点差异。而与现用的疫苗株(Shanghai-191)相比,存在17~19个氨基酸变异位点,其中有14个氨基酸位点为所有福建株共有的变异位点,这些位点的变异总体上未对编码蛋白的氨基酸造成明显改变。结论是福建省成功分离获得1株D8基因型麻疹毒株。D8基因型为福建省发现的输入性麻疹基因型,病毒N蛋白羧基端氨基酸位点上与疫苗株相比均出现了差异位点。
文章关键词:麻疹病毒,输入性,D8基因型,
项目基金:国家科技重大专项(项目号:2017ZX10103008-004),题目:浙江及周边省传染病病原谱流行规律研究—五大症候群病原谱监测,
论文作者:李东1 张苏晗1 陈致飞1 张海荣1 潘伟毅1 周勇1,2
作者单位:2. 福建医科大学公共卫生学院教学基地
论文DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004026
论文分类号: R511.1;R181.3
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